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signtool.exe を用いたデジタル署名を行おうとしているのですが、
うまくいきません。
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/8s9b9yaz(VS.80).aspx

1) .exe をデジタル署名した場合
ファイルサイズが変わりすぎたためか「Startup Failed」となります

2) hsprt をデジタル署名した場合
.exe にもデジタル署名が残るのですが無効になります

試しにということで、他の言語で書かれたexeを署名してみるとうまく
行くので、signtoolの使い方が間違っている訳ではなさそうです。

Vista以降、デジタル署名無しだと色々支障があるので、出来れば実装
したいと考えています。どなたか解決策ご存じないでしょうか？

よろしくお願いいたします。

この件どなたかおわかりになる方いらっしゃいませんか？
やはり個人ベースではデジタル署名されてる方って相当
レアなんでしょうか（確かに個人で署名取得は大変ですが）

ご質問ありがとうございます。
デジタル署名については、まだ正式な対応を行なっていないため、現状のシステムとは
相性が悪いのではないかと思われます。
ファイルサイズが変わることは問題ありませんが、起動時に読み込む自分自身の
ファイル内容が変わっているため、正しく認識できないのではないでしょうか。
対応については検討しますが、exeの作成方法を変更しないと難しいかもしれません。