うーん、軽く調べてみた感じプレーヤの機能自体に非表示にするものは無さそうですかね。
(もっと詳しく調べたらあるのかもしれませんが・・・)
何も考えずに簡単なのは bgscrで作ったウィンドウを子ウィンドウ化して、それにプレーヤを乗せて表示/非表示を切り替えてしまうことだと思います。
リンク先の あらやさんのサンプルスクリプトをお借りしました。
#include "user32.as"
#define GWL_STYLE 0xFFFFFFF0
#define WS_POPUP 0x80000000
#define WS_CHILD 0x40000000
#define IID_IMFPMediaPlayer "{A714590A-58AF-430a-85BF-44F5EC838D85}"
#usecom IMFPMediaPlayer IID_IMFPMediaPlayer "{}"
#comfunc IMFPMediaPlayer_Stop 5
#comfunc IMFPMediaPlayer_Shutdown 38
#uselib "Mfplay"
#func MFPCreateMediaPlayer "MFPCreateMediaPlayer" wstr,int,int,int,int,var
#uselib "Mfplat"
#func MFStartup "MFStartup" int,int
#func MFShutdown "MFShutdown"
//動画を乗せる子ウィンドウを作る
bgscr 1,600,400,2,100,100 ;とりあえず非表示で作っておく
hw1 = hwnd ; MFPCreateMediaPlayerでこの hw1 を指定します。
GetWindowLong hw1, GWL_STYLE
SetWindowLong hw1, GWL_STYLE, stat | WS_POPUP^WS_POPUP | WS_CHILD ; 子ウィンドウ用のスタイルに変更 (安全のためWS_POPUPは付けてから反転して外している)
screen 0,800,600
cls 1
SetParent hw1, hwnd // bgscr 1 を screen 0 の子ウィンドウに登録
title "Media Foundation"
objsize 200,24
button gosub "表示 / 非表示",*lShow
//ファイル指定
dialog "mp4;*.avi;*.mpg;*.mpeg",16
if stat=0 : end
file=refstr
onexit *lEnd
//動画読み込み
newcom iMFPlayer,IMFPMediaPlayer
MFStartup
MFPCreateMediaPlayer file, 1,0,0, hw1, iMFPlayer
; ↑0にすると自動再生しない
//動画(子ウィンドウ)を表示
gsel 1,1 : gsel 0
stop
//動画の表示/非表示
*lShow
if flg!-1 : flg=-1 : else : flg=1
gsel 1,flg : gsel 0
mes "動画(子ウィンドウ)表示フラグ: "+flg
return
//終了処理
*lEnd
IMFPMediaPlayer_Stop iMFPlayer
IMFPMediaPlayer_Shutdown iMFPlayer
MFShutdown
mes "MFShutdown:"+stat
end